Tommy og Annika far og mor skal ud og rejse i 3 uger, og har ladet sig overtale til at Tommy og Annika bliver hjemme, og lader Pippi holde et vågent øje med dem.
Lige så snart forældrene er taget afsted, kommer der en flaskepost fra Pippi far, der er blevet taget til fange af to farlige sørøvere. Pippi må lige ordne sine sædvanlige mellemværender med Pruseliua, Kling og Klang, men så pakker de tre børn deres kufferter, og tager til Sydhavet for at frelse Kaptajn Langstrømpe.